酶标仪的分析原理与分光光度法一样，服从朗伯比尔定律。物质的含量与显色液的颜色深浅成正比，而颜色深浅可用吸光度表示，所以物质的含量与吸光度值成正比。酶标记抗原或者抗体发生免疫学反应后，与底物的结合物，在特定波长下有大吸收，可通过测定显色液的吸光度对待测物进行定量。

　　面对类型如此众多的酶标仪，实验室在选择时往往有难以适从的感觉。一般来说，用于酶免疫测定比色的酶标仪可分为普通酶标仪，多功能全自动酶标仪和全自动酶免疫分析系统等，普通酶标仪的功能基本上相当于一个微孔板比色计，而多功能全自动酶标仪除了有微孔板比色功能外，还有酶标动力学，紫外乃至凝集等多种检测功能；全自动酶免疫分析系统则有试剂“开放”和“限定”之分，所谓试剂“开放”是指不同品牌的ELISA试剂均可用于该仪器，而试剂“限定”则必须使用仪器的酶免测定试剂。

　　实验室在选择酶标仪时，一般应遵循这样几条原则：

　　1.根据工作需要去选择

　　切忌刻意去求功能多，因为一则如果仪器功能过多，易出故障，二则有些功能如酶标动力学或凝集等，可能根本就用不上；如果拟购置的酶标仪主要是用于定性测定，则不必要求完美的定量所需的软件系统。至于全自动酶免疫分析系统则对工作量比较大的血站或大型医院较为适用，对于日常工作量不太大的实验室，就无必要。

　　2.根据酶标仪的性能去选择

　　反应酶标仪性能的指标主要有测定波长范围，滤光片配置，检测速度，吸光度范围，线性范围，分辨率，准确度，精密度等。

　　3.根据自己实验室的财力去选择

　　酶标仪品种类型多，由于性能不一，价格自然也就相差较大，实验室可根据自己的财力去选择性能／价格比较为合适的酶标仪。

　　4.根据售后服务去选择

　　实验室仪器买了以后，就跟我们家里使用的家用电器一样，在使用过程中及使用一段时间之后，很可能就会有保修或维修方面的问题，因此一定要选择售后服务好的公司的酶标仪。